新葡的京集团8814崔银秋教授团队与国内外多家单位合作,利用最新的古DNA技术,在乙型肝炎病毒的起源与演化研究上取得新进展,研究论文“Origin and dispersal history of Hepatitis B virus in Eastern Eurasia”在线发表于4月5日的Nature Communications上。
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乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)感染是全球范围内一个重要的公共卫生问题, 是慢性肝炎、肝硬化及肝癌发生的主要原因。许多研究表明HBV感染人类的历史最早可追溯至一万年前。目前已有的研究还原了HBV在西部欧亚大陆的基因型替换事件,并且揭示了HBV进化与人群迁移的一致性。然而,东部欧亚大陆古代HBV基因组数据的缺乏严重限制了古代HBV研究的发展,使得我们很难从整体的角度探究HBV的起源与进化历史。
崔银秋教授团队针对近千例古代人类个体的宏基因组数据筛选开启了东欧亚大陆的古代HBV的进化研究,并最终在17个遗址年代从距今约 5000 -400 年的34个个体中检测到感染的HBV片段并获取了高质量的HBV基因组序列信息。研究结果表明,B型和D型基因可能起源于东亚;同时与欧亚大陆西部相比,在距今 5000 至 3000 年间欧亚大陆东部的 HBV 多样性水平更高,出现了五种不同的基因型(A、B、C、D、WENBA)共存的现象,这凸显了人类迁徙和互动在 HBV 传播中的重要性。研究还首次发现了存在从非重组亚基因型(B1、B5)向重组亚基因型(B2 - B4)过渡的可能。
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研究强调了将古代基因组纳入乙型肝炎进化历史研究的必要性,反映了人群扩散和流动对乙型肝炎传播的促进作用,强调了数千年来乙肝病毒与人类之间的紧密联系。同时通过对整个欧亚大陆不同时期乙型肝炎病毒分布的统计(见图1),还原了乙型肝炎病毒分布和扩散的动态过程。这些古代序列为阐明乙肝病毒不同基因型的区域起源和病毒亚基因型演化,以及理解过去疾病传播与人群流动之间关系提供重要研究材料(见图2)。
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新葡的京集团8814的博士研究生孙冰与德国马克斯-普朗克进化人类学研究所的Aida Andrades Valtueña博士为本文共同第一作者,崔银秋教授和德国马普进化人类学研究所的Johannes Krause教授, Alexander Herbig教授为本文共同通讯作者。该工作在国家自然科学基金项目(No.42372017)的资助下完成。
全文链接:doi.org/10.1038/s4146